覃桂敏
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西安电子科技大学计算机科学与技术学院博士、副教授、硕士生导师。先后于西安电子科技大学机电工程专业、计算机软件与理论、计算机应用技术获学士、硕士和博士学位。曾在同济大学电子与信息工程学院计算机科学与技术博士后流动站学习和研究三年,在美国德州大学休斯敦健康科学研究中心访问研究一年。中国计算机学会会员,中国抗癌协会会员,生物信息学专业委员会委员,肿瘤标志专业委员会委员。ICIBM2018和ICIBM2020会议程序委员会委员(PC Member)。在科研方面,主持国家自然科学基金青年项目、博士后基金项目、陕西省自然科学基金项目和企业软件研发项目,参与国家自然科学基金重点项目、面上项目和多项工业软件研发项目。在Bioinformatics、Pattern Recognition、Epigenetics、Scientific Reports、IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB)、BMC Bioinformatics、BMC Medical Genomics等知名国际期刊发表十多篇SCI论文。
主要研究方向:
复杂网络理论与应用:生物分子网络、多层网络等建模和分析
机器学习算法与应用:图数据的机器学习算法
生物医学信息学:基于多组学的癌症分子机制研究、医案首页分析
深度学习:医学影像数据的深度学习模型构建和分析
部分论文列表:
[1] Saurav Mallik,Guimin Qin, Peilin Jia, Zhongming Zhao. Molecular signatures identified by integrating gene expression and methylation in non-seminoma and seminoma of testicular germ cell tumors.Epigenetics. (Accepted)
[2]Guimin Qin#, Saurav Mallik#, Ramkrishna Mitra, Aimin Li, Peilin Jia, Christine Eischen, Zhongming Zhao*. MicroRNA and transcription factor co-regulatory networks and subtype classification of seminoma and non-seminoma in testicular germ cell tumors.Scientific Reports, 2020,10(1): 1-14.
[3]Guimin Qin, Luqiong Yang,Yuying Ma, Jiayan Liu,Qiuyan Huo. The Exploration of Disease-specific Gene Regulatory Networks in Esophageal Carcinoma and Stomach Adenocarcinoma-manuscript. BMC Bioinformatics.2019, 20(Suppl 22):717.
[4] Aimin Li#,Guimin Qin#, Akiko Suzuki, Mona Gajera, Junichi Iwata, Peilin Jia*, Zhongming Zhao*. Network-based identification of critical regulators as putative drivers of human cleft lip.BMC Medical Genomics, 2019, 12(1): 16~16.
[5]覃桂敏,刘佳妍,殷雨等.基因调控网络中的癌症标记物预测方法[J].西安电子科技大学学报, 2019,46(06):81-87.
[6] Qiuyan Huo, Yuying Ma, Yu Yin,Guimin Qin*. Biomarker Identification for Liver Hepatocellular Carcinoma and Cholangiocarcinoma Based on Gene Regulatory Network Analysis [J].Current Bioinformatics.(已录用)
[7]Guimin Qin,Luqiong Yang,Jiayan Liu,Qiuyan Huo. Integrative Analysis of Gene Regulatory Networks in Esophageal Carcinoma and Stomach Adenocarcinoma.IDMB2019, 2019, Jun 21-23.
[8] Xiaoke Ma*, Penggang Sun,GuiminQin. Nonnegative matrix factorization algorithms for link prediction in temporal networks using graph communicability.PatternRecognition. 71(2017)361-374
[9] Xiaoke Ma, Penggang Sun,Guimin Qin. Identifying condition-specific modules by clustering multiple networks.IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics. 2017 Oct 10.
[10]Shengli Song*, Xiang Zhang,GuiminQin, Multi-domain Ontology Mapping based on Semantics,ClusterComputing, 2017, 20(4): 3379-3391
[11]Guimin Qin, Ruiyi Li,Xingming Zhao. PhosD: inferring kinase–substrate interactions based on protein domains.Bioinformatics. 2016 Dec 28;33(8):1197-204.
[12]Guimin Qin,Ruiyi Li,Xingming Zhao. Identifying disease associated miRNAs based on protein domains.IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics. 2016 Nov 1;13(6):1027-35.
[13]Guimin Qin,Yibo Hou,Xingming Zhao. A systematic exploration of the associations between amino acid variants and post-translational modifications.Neurocomputing. 2016 Sep 19;206:13-8.
[14]Guimin Qin,Yibo Hou,Baoguo Yu,Xiyang Liu. A disease module detection algorithm for lung adenocarcinoma tumor network with significance of connections and network controllability methodology.2016 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2016 Dec 15 (pp. 1834-1840). IEEE.
学生去向:高校、华为、中兴、百度、腾讯、银行、创业等
邮箱 :
2006.9 -- 2012.9
西安电子科技大学 计算机应用技术 博士研究生毕业 博士学位
2001.9 -- 2004.3
西安电子科技大学 计算机软件与理论 硕士研究生毕业 硕士学位
1995.9 -- 1999.6
西安电子科技大学 机电工程 大学本科毕业 学士学位
2017.9 -- 2018.9
美国德州大学德州大学休斯敦健康科学研究中心访问学者
2013.1 -- 2016.1
同济大学电子与信息工程学院博士后
2011.6 -- 至今
西安电子科技大学计算机科学与技术学院副教授
2006.6 -- 2011.6
西安电子科技大学软件学院讲师
2004.4 -- 2006.6
西安电子科技大学软件学院助教
中国计算机学会会员,生物信息学专业委员会委员
ICIBM2018和ICIBM2020 会议程序委员会委员(PC Member)
复杂网络理论与应用:生物分子网络、多层网络等建模和分析
机器学习算法与应用:图数据的机器学习算法
生物医学信息学:基于多组学的癌症分子机制研究、医案首页分析
深度学习:医学影像数据的深度学习模型构建和分析