| 系 统 软 件 资 源 |
| 操作系统 |
Linux CentOS 7.7 64bit |
| 作业调度 |
JH Unischeduler 5.3.1 |
| 编 译 器 |
gcc，intel oneapi |
| 数 学 库 |
Intel MKL、FFTW 3.3.10、Openblas、Blas等 |
| 并行环境 |
Intel MPI、OpenMPI、Mpich等并行环境 |
| GPU环境 |
CUDA (8.0、9.2、10.2、11.4、11.8)cuDNN( 8.0、8.3、8.4、8.5) |
| 应 用 软 件 资 源 |
| 软 件 名 |
版 本 |
简 介 |
| MATLAB |
2020b,2021a |
MATLAB是美国MathWorks公司出品的商业数学软件， 用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算的 高级技术计算语言和交互式环境 |
| TensorFlow |
2.1 |
TensorFlow是谷歌基于DistBelief进行研发的第二代
人工智能学习系统，其命名来源于本身的运行原理。
|
| PyTorch |
1.7 |
开源的python机器学习库 |
| LAMMPS |
29-Oct-20 |
一套分子动力学模拟器，原子分子大规模并行模拟 |
| R |
4.2,4.2.2 |
为数学研究工作者设计的一种数学编程语言 |
| Gamess |
|
GAMESS是量子化学软件，很大程度上可做业务Gaussion的替代 |
| AutoDock |
|
Autodock是一款开源的分子模拟软件，最主要应用于执行配体—蛋白分子对接 |
| Gromacs |
2022 |
研究生物分子体系的分子动力学程序包 |
| Ncbi-blast |
2.13.0 |
一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具 |
| Nwchem |
7 |
运行在高性能并行超级计算机和通常工作站集群上的计算化学软件 |
| Uspex |
10.5 |
基于进化算法的晶体结构预测方法 |
| Vtk |
9.2.2 |
一个开源的免费软件系统，主要用于三维计算机图形学、图像处理和可视化。 |
| Anaconda |
|
一个用于科学计算的 Python 发行版，支持 Linux, Mac, Windows,
包含了众多流行的科学计算、数据分析的 Python 包。 |
| Namd |
2.1.4 |
用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学代码 |
| Orca |
5.0.1 |
量子化学程序包，包含现代电子结构方法，包括
密度泛函理论、多体扰动、耦合群、多参考方法和半经验量子化学方法 |
| Perl |
5.36.0 |
一种功能丰富的计算机程序语言 |
| Python |
|
一种广泛使用的解释型、高级和通用的编程语言 |
| Cmake |
3.25 |
跨平台的编译工具，生成Makefile文件 |
